Добрый день!
Цитата: 4. ...В случае, если несколько обособленных подразделений организации находятсяв одном муниципальном образовании, городах федерального значения Москве, Санкт-Петербурге и Севастополе на территориях, подведомственных разным налоговым органам, постановка организации на учет может быть осуществлена налоговым органом по месту нахождения одного из ее обособленных подразделений, определяемого этой организацией самостоятельно. Сведения о выборе налогового органа организация указывает в уведомлении, представляемом (направляемом) российской организацией в налоговый орган по месту ее нахождения, иностранной организацией - в выбранный ею налоговый орган.
Да, "объединиться" могут только несколько ОП одной организации.
Сама организация со своим ОП объединиться не может.
Это касается постановки на учет в налоговом органе.
Что касается налога на прибыль, то тут могут объединиться голова и её ОП, находящиеся в одном субъекте федерации.
Читаем первоисточник:
Цитата: 4.5.1 ...Еслиорганизация и ее одноили несколько обособленных подразделений находятся на территорииодного субъекта Российской Федерации, то налогоплательщик вправе принять решение об уплате им налога на прибыль в бюджет этого субъекта Российской Федерации. В этом случае Уведомление N 1 представляется в налоговый орган по месту нахождения организации (если налогоплательщик относится к категории крупнейших, то Уведомление N 1 представляется в налоговый орган по месту его учета в качестве крупнейшего налогоплательщика).
Так что, ставить на учет надо в разных инспекциях, а потом можно подавать уведомление № 1 в головную инспекцию и платить всё в одну инспекцию.
В 2017 году существовала практика, когда налоговики разрешали и на учет ставить вместе с головой.
Тот факт, что Вас 6 лет не тревожили после подачи формы "1-6-учет" подтверждает такую практику.
Теперь, видимо, пришли новые люди и новые установки сверху.
Успехов!